O Tabapuã vem do gado baio nacional mocho. Este gado é oriundo do cruzamento do nelore com o Mocho Nacional. A denominção Tabapuã foi feita pelo Ministério da Agricultura ao considerá-la oficialmente como raça.

Teve sua origem na Fazenda Água Milagrosa, município de Tabapuã-SP, seguindo assim uma tradição de dar a uma raça o nome do município onde se originou.

Ao longo de 30 anos de seleção, alguns outros criadores aderiram também ao gado mocho, formado a partir do Mocho Nacional e do Zebu. Desse padrão racial, surgiu a Associação Brasileira dos Criadores de Tabapuã (ABCT) e com ela, a padronização do rebanho que se formava.